實時熒光定量PCR是一種在DNA擴增反應中,以熒光化學物質測每次聚合酶鏈式反應(PCR)循環(huán)后產物總量的方法。通過內參或者外參法對待測樣品中的特定DNA序列進行定量分析的方法。
熒光PCR方法檢測病原體已成為常規(guī)檢測技術,在工作過程中我們也遇到了各種各樣、千奇百怪的問題,那么在PCR儀出現(xiàn)故障的時候應該怎么解決呢?
01反應后反應管壁出現(xiàn)液滴?
原因1:運行程序前沒有開啟熱蓋加熱功能
解決方法:開啟熱蓋加熱功能
原因2:反應結束后低溫保存時間過久
解決方法:運行結束后,熱蓋將自動關閉,所以冷凝會自然出現(xiàn),這不會對實驗結果產生影響,將反應管置于離心機上瞬時離心機使液滴回到管子底部即可。
02反應管氣泡在 PCR 反應時,加熱破裂
反應時在實驗過程中出現(xiàn)了氣泡,導致中途產生了較大的波動,其特點是單個樣本的幾個通道的熒光曲線同時在某個循環(huán)出現(xiàn)趨勢一致的波動。
分析原因:氣泡在 PCR 反應的過程中被加熱,在某個時刻破裂,此時出現(xiàn)熒光擾動,在這個循環(huán)檢測到的熒光型號和上一個循環(huán)不一樣,此時如果波動位于基線期很可能就被軟件識別為開始擴增的拐點,擴增曲線就會產生結果。
03使用微孔板,
反應后反應液有明顯蒸發(fā)?
方法1:確保使用高質量的微孔板,反應前要嚴格密封;
方法2:確保蓋熱蓋,適當提高熱蓋的溫度;
方法3:增大反應體積。
04使用PCR管,
反應后PCR的管內反應液有明顯蒸發(fā)?
方法1:確保使用高質量的PCR管;
方法2:在樣品臺的四角放置四個同樣的空PCR管,以保證熱蓋壓在哥PCR管上的壓力均勻。
05PCR實驗結束后,
樣品可以一直放在PCR儀中低溫保存嘛?
當程序運行結束后,及時取出樣品并停止儀器運行,而不要把儀器當“冰箱”使用,低溫保存時溫度盡量設定得比較高,如8℃,這可以延長儀器的使用壽命。